Для Мицуки Ямато вторжение начинается с исчезновения космической экспедиции. Работая в японском центре управления полётами, она замечает странный сигнал и пытается выяснить, что произошло с кораблём. В это же время американский военный Треванте Коул сталкивается с неизвестным противником в Афганистане. Его отряд гибнет, а сам он оказывается далеко от дома посреди событий, которые никто не может объяснить. У врача Аниши Малик другие заботы. Она узнаёт о неверности мужа Ахмеда, но семейные проблемы быстро отходят на второй план, когда по всему миру начинаются нападения пришельцев. Аниша увозит сына Люка и дочь Сару из дома и ищет безопасное место. В Англии школьная поездка превращается в борьбу за выживание для Каспара Морроу, Джамилы Хьюстон и их одноклассников. Каспара мучают приступы и видения, в которых постепенно обнаруживается связь с пришельцами. Когда становится ясно, что отдельные существа подчиняются единому разуму, Мицуки начинает искать способ использовать эту связь. Она работает с учёными над инопланетным объектом, обнаруженным в амазонских джунглях. Треванте пытается разобраться в рисунках Каспара и загадке исчезнувших людей. Аниша присоединяется к группе сопротивления, знакомится с Кларком Эвансом и борется за возвращение Сары после её похищения военными. Тем временем Люк учится воздействовать на существ, которых остальные могут только бояться. Попытка проникнуть на материнский корабль приводит Треванте и Каспара в самое сердце инопланетной сети. Через два года после падения корабля жизнь на Земле кажется спокойнее, но пришельцы вновь дают о себе знать. Треванте возвращается, Мицуки улавливает новые сигналы, а Джамила ищет ответы о судьбе Каспара. Все они постепенно оказываются вовлечены в операцию против оставшихся инопланетных сил. Одновременно набирает влияние «Инфинитас», движение Верны, убеждённой, что контакт с пришельцами позволит вернуть умерших близких. Оно угрожает планам военных и семье Аниши, успевшей начать новую жизнь с Кларком. Путь к материнскому кораблю приводит к тяжёлым потерям. Треванте и его спутники пытаются уничтожить центр управления пришельцами, а Мицуки принимает решение, от которого зависит исход операции. После разрушения связи с враждебными существами у выживших появляется возможность вернуться к мирной жизни, хотя пережитое навсегда меняет каждого из них.