Росомаха покидает особняк Людей Икс после очередного спора с Циклопом. Вскоре после его ухода происходит мощный взрыв, который уничтожает школу профессора Ксавьера. Сам Чарльз Ксавьер и Джин Грей бесследно исчезают, а оставшиеся без наставника Люди Икс расходятся. Проходит год. Росомаха живёт отдельно и старается не вмешиваться в дела бывшей команды. Но положение мутантов становится всё опаснее. Власти усиливают контроль, а специальное подразделение начинает задерживать обладателей необычных способностей. Росомаха понимает, что оставаться в стороне больше нельзя. Он возвращается к разрушенному особняку и решает снова собрать Людей Икс. Первым рядом с ним оказывается Зверь. После исчезновения Ксавьера он продолжал изучать причины загадочного взрыва и не оставлял надежды выяснить судьбу профессора и Джин. Вместе они начинают искать остальных членов команды. К ним возвращяются Шторм, Ночной Змей, Китти Прайд и Ледяной Человек. Не все готовы сразу забыть произошедшее. Особенно трудно вернуть Циклопа. Исчезновение Джин сильно изменило Скотта Саммерса. Он отдалился от друзей и потерял желание продолжать прежнюю борьбу. Положение меняется, когда Люди Икс неожиданно получают сообщение от профессора Ксавьера. Оказывается, его сознание находится в будущем. Чарльз предупреждает Росомаху о катастрофе, которая должна произойти через двадцать лет. В этом будущем мутанты почти полностью лишены свободы, а мир находится под контролем Стражей. Причиной подобных событий становятся решения, принимаемые в настоящем. Ксавьер просит Росомаху вновь объединить Людей Икс и не допустить такой судьбы. Теперь Логану приходится занять место, к которому он никогда не стремился. Он становится лидером команды. Росомаха привык действовать самостоятельно и полагаться на собственные инстинкты, но теперь отвечает не только за себя. Одновременно Люди Икс пытаются выяснить, что произошло с Джин Грей. Следы взрыва указывают на мощную энергию, природу которой Зверь пока не способен полностью объяснить. Ситуацию осложняет Магнето. Он создаёт Геношу, где мутанты могут жить отдельно от людей. Некоторые видят в острове возможность избавиться от постоянного преследования. Но цели Магнето значительно сложнее. Его дочь Алая Ведьма помогает управлять Геношей, а сам Магнето продолжает внимательно следить за действиями людей. Тем временем программа по борьбе с мутантами становится всё опаснее. Создаются новые Стражи, способные выслеживать и захватывать их. Людям Икс приходится освобождать пленников и искать тех, кто стоит за разработкой этих машин. Каждое столкновение приближает настоящее к будущему, которое видел Ксавьер. Росомаха пытается изменить ход событий, одновременно разыскивая Джин и удерживая собранную команду вместе. Теперь от решений Людей Икс зависит не только судьба отдельных мутантов. Им необходимо предотвратить катастрофу, последствия которой профессор Ксавьер уже увидел собственными глазами.
