Профессор Чарльз Ксавьер много лет занимается поиском людей, родившихся с необычными способностями. Он сам является мутантом и способен читать мысли окружающих. В своём особняке Ксавьер открывает школу, где такие люди могут жить, учиться управлять своими силами и не бояться того, что делает их непохожими на остальных. Из учеников и союзников профессор собирает команду Людей Икс. Циклоп становится её полевым лидером. Без специального визора он не способен контролировать энергетические лучи, постоянно исходящие из его глаз. Джин Грей использует телепатию и телекинез. Шторм управляет погодой. Зверь сочетает огромную физическую силу с выдающимися научными знаниями. Роуг вынуждена избегать прикосновений к другим людям, поскольку вместе с контактом может забрать их силы и воспоминания. Гамбит способен заряжать предметы энергией и превращать обычную игральную карту в опасное оружие. Росомаха отличается от остальных даже внутри этой необычной команды. Он обладает ускоренным восстановлением и металлическими когтями. Многие события собственного прошлого Росомаха не помнит. Обрывочные воспоминания заставляют его искать людей, которые когда-то проводили над ним эксперименты. К команде присоединяется Джубили. Девушка недавно обнаружила способность создавать энергетические вспышки и ещё не понимает, как контролировать собственную силу. Знакомство с Людьми Икс показывает ей, что таких, как она, намного больше. Но вместе с новыми друзьями Джубили узнаёт и об опасностях. Обычные люди всё сильнее боятся мутантов. Для борьбы с ними создаются Стражи. Эти огромные машины способны обнаруживать мутантов и предназначены для их захвата. Люди Икс оказываются между двумя сторонами растущего конфликта. Ксавьер пытается доказать, что мирное сосуществование возможно. Его давний знакомый Магнето придерживается противоположного мнения. Способность управлять металлом делает Магнето одним из сильнейших мутантов. Он не доверяет человечеству и считает, что ожидание мирных перемен лишь подвергает мутантов новой опасности. Различие взглядов превращает бывших друзей в противников. Их борьба выходит далеко за пределы личного конфликта. Люди Икс сталкиваются с Магнето и его сторонниками, охотниками на мутантов и теми, кто хочет использовать необычные способности в собственных целях. Некоторые противники связаны с прошлым самих членов команды. Другие появляются из-за страха людей перед тем, чего они не понимают. Ксавьер продолжает принимать в школу новых мутантов. Его ученики тренируются вместе и учатся использовать способности так, чтобы не причинять вред окружающим. Но покинув стены особняка, они снова оказываются в мире, где одно лишь существование мутантов способно вызвать страх и ненависть. И Люди Икс продолжают защищать этот мир, даже когда им самим приходится бороться за право быть его частью.