Эллиот Алдерсон умеет узнавать о людях то, что они никогда не рассказали бы добровольно. Для этого ему не нужны долгие разговоры. Достаточно компьютера и нескольких следов, оставленных человеком в сети. Днём Эллиот работает специалистом по кибербезопасности в «Allsafe». Его задача заключается в защите компаний от взломов и поиске уязвимостей в их системах. Ночью он использует те же навыки самостоятельно. Эллиот изучает цифровую жизнь людей, которых считает опасными, собирает доказательства и иногда передаёт найденную информацию полиции. Так ему проще взаимодействовать с окружающим миром. Обычное общение даётся Эллиоту намного тяжелее, чем работа с компьютерными системами. Одним из немногих близких ему людей остаётся Анджела Мосс. Они дружат с детства и вместе работают в «Allsafe». Их связывает ещё и общее прошлое. Родители Эллиота и Анджелы пострадали после работы на «E Corp», крупнейшую корпорацию, с которой теперь сотрудничает «Allsafe». Эллиот ненавидит эту компанию, но по долгу службы вынужден защищать её инфраструктуру. Во время одной из атак на «E Corp» он обнаруживает след, который намеренно оставил неизвестный хакер. Вместо обычного расследования Эллиот получает приглашение на встречу. Так он знакомится с Мистером Роботом, лидером небольшой группы fsociety. Её участники собираются осуществить операцию, способную уничтожить финансовые записи «E Corp». Если план сработает, огромные объёмы информации о долгах исчезнут. Мистер Робот считает, что это позволит изменить существующий порядок и ударить по корпорации там, где она наиболее уязвима. Для реализации плана группе нужен Эллиот. Он знает систему защиты «Allsafe» и имеет доступ к инфраструктуре главного противника. Сначала Эллиот сомневается. Но желание наказать «E Corp» постепенно оказывается сильнее опасений. Внутри fsociety он встречает Дарлин. Она ведёт себя так, словно давно его знает, хотя сам Эллиот не понимает причины такой близости. Одновременно он продолжает ходить на работу и делать вид, что занимается защитой «E Corp». Никто из коллег не должен узнать, что один из специалистов «Allsafe» помогает людям, готовящим атаку. В самой корпорации Эллиот знакомится с Тайреллом Уэлликом. Амбициозный руководитель стремится получить более высокую должность и постепенно начинает проявлять необычный интерес к сотруднику «Allsafe». Чем дальше продвигается подготовка, тем труднее Эллиоту понимать происходящее вокруг. Некоторые воспоминания исчезают, а знакомые люди рассказывают ему о событиях, которых он совершенно не помнит. Мистер Робот тоже ведёт себя всё более непредсказуемо. Иногда он помогает Эллиоту, иногда намеренно заставляет его делать то, чего тот сам делать не хочет. Попытка разобраться в происходящем приводит Эллиота к тайнам собственной семьи. Он обнаруживает, что неправильно воспринимал некоторые события прошлого и даже людей рядом с собой. Но остановить уже запущенный план становится практически невозможно. fsociety готовится нанести главный удар по «E Corp». После атаки финансовая система погружается в хаос. Миллионы людей действительно освобождаются от части долговых записей, но вместе с этим начинаются проблемы, которых участники группы не предусмотрели. За кулисами действует «Dark Army». Организацию возглавляет Уайтроуз, обладающая собственными планами в отношении «E Corp», fsociety и самого Эллиота. Постепенно он понимает, что первоначальная атака была лишь началом. Теперь Эллиоту приходится бороться не только с корпорацией и людьми, использующими его способности, но и с Мистером Роботом, который способен продолжать начатое даже тогда, когда сам Эллиот пытается всё остановить.
