В 2071 году люди живут на разных планетах и спутниках Солнечной системы, а космические путешествия давно стали обычным делом. Вместе с новыми городами появились преступные группировки, которые занимаются контрабандой, торговлей наркотиками и вооружёнными ограблениями. Полиция не всегда успевает разыскивать беглецов, поэтому за их поимку назначают награды. Этим зарабатывают на жизнь Спайк Шпигель и Джет Блэк, путешествующие на космическом корабле «Бибоп». Спайк хорошо владеет оружием и боевыми искусствами, но часто действует необдуманно. Джет, бывший полицейский с механической рукой, предпочитает заранее продумывать каждую операцию. Разница в характерах постоянно становится причиной споров. Напарники преследуют преступников на космических станциях, посещают опасные районы крупных городов и нередко возвращаются на корабль без денег. Иногда задержать разыскиваемого мешают обстоятельства, а иногда сам Спайк разрушает тщательно подготовленный план. Во время очередного задания они встречают Фэй Валентайн, мошенницу, которая тоже пытается заработать на поимке преступников. Девушка умеет обманывать людей и быстро находить выход из неприятных ситуаций. Однако за её уверенным поведением скрывается собственная проблема. Фэй почти ничего не помнит о прошлом, поскольку много лет провела в криогенном сне. Она пытается восстановить утраченную память и выяснить, что произошло с ней до пробуждения. После нескольких совместных приключений Фэй остаётся на «Бибопе». Ей непросто привыкнуть к Джету, который требует соблюдать порядок, и Спайку, постоянно ввязывающемуся в драки. Тем не менее троица продолжает работать вместе. Они разыскивают убийц, торговцев запрещёнными веществами и других преступников, за которых обещают крупные награды. Каждая новая охота приводит их в незнакомые места и заставляет сталкиваться с людьми, у которых есть собственные причины скрываться от закона. Постепенно выясняется, что Спайк сам когда-то принадлежал к преступному миру. Раньше он состоял в могущественном синдикате «Красный дракон» и работал вместе с Вишесом, одним из самых опасных его участников. Мужчины долгое время доверяли друг другу, пока между ними не встала Джулия. Спайк полюбил женщину, которая была связана с Вишесом, и решил покинуть организацию. Чтобы избавиться от преследования, Спайк инсценировал собственную смерть. Он рассчитывал начать новую жизнь вместе с Джулией, но их побег не состоялся. Спайку пришлось скрываться одному, а Джулия осталась в прежнем окружении. С тех пор он старается не возвращаться к этим событиям и почти ничего не рассказывает Джету о своём прошлом. Вишес тем временем продолжает укреплять положение внутри «Красного дракона». Он стремится получить власть над синдикатом и готов устранить любого, кто мешает его планам. Джулия вынуждена жить рядом с ним, хотя давно перестала доверять его решениям. Узнав, что Спайк выжил, Вишес начинает искать бывшего напарника, чтобы окончательно расправиться с ним. Пока Спайк пытается избежать встречи с прежними сообщниками, Джет занимается собственными проблемами. После ухода из полиции он потерял привычную жизнь и отдалился от семьи. Особенно тяжело ему даются отношения с дочерью Кимми. Джет старается проводить с ней больше времени, но опасная работа постоянно нарушает его планы. Встречи с бывшими коллегами напоминают ему о предательстве, из-за которого он когда-то лишился руки. Фэй продолжает расследовать обстоятельства своего прошлого. Она ищет людей, которые могли знать её до криогенного сна, изучает сохранившиеся документы и постепенно узнаёт подробности прежней жизни. Полученная информация заставляет её иначе взглянуть на собственную судьбу. Девушка понимает, что не сможет вернуть потерянные годы, но всё ещё надеется найти место, где сможет начать жизнь заново. Тем временем конфликт внутри «Красного дракона» становится всё опаснее. Вишес пытается захватить руководство организацией, а Джулия начинает действовать самостоятельно. Её решения меняют расстановку сил в синдикате и вновь связывают её судьбу со Спайком. Когда люди Вишеса выходят на след бывшего сообщника, под угрозой оказываются Джет и его дочь. Спайк больше не может скрывать своё прошлое от напарников. Джет узнаёт, с кем раньше был связан человек, которому он доверил место на собственном корабле. Между ними возникает серьёзный конфликт, поскольку тайны Спайка подвергли опасности его семью. Фэй тоже оказывается втянута в противостояние, хотя первоначально не имела никакого отношения к преступному синдикату. Спайк решает встретиться с Вишесом и положить конец многолетней вражде. Однако Джулия преследует собственные цели и не собирается просто возвращаться к прежним отношениям. Борьба за власть внутри «Красного дракона» приводит к неожиданной развязке, после которой жизнь Спайка меняется.
