Жизнь Джейка Салли на Пандоре наполнилась новым смыслом: теперь он не просто воин, а отец, чья главная заповедь — «семья — это крепость». Однако покой нарушается, когда в небе Пандоры вновь загораются огни человеческих кораблей. На этот раз люди вернулись не просто за ресурсами, а чтобы превратить планету в свой новый дом. Возглавляет вторжение «рекомбинант» Майлза Куоритча — клон полковника, наделенный его памятью и помещенный в тело аватара, чтобы выследить Джейка на его же территории. Понимая, что его присутствие подвергает лесной народ Оматикайя смертельной опасности, Джейк принимает тяжелое решение. Он отрекается от титула вождя и уводит свою семью к далеким островам, где обитает клан Меткайина — повелители рифов. Там лесным жителям приходится осваивать «путь воды»: учиться дышать под водой, приручать морских существ и понимать ритм океана, который связывает всё живое на Пандоре. Но Куоритч, движимый жаждой мести, не намерен отступать. Он начинает жестокую охоту, уничтожая священных для морских кланов существ — разумных тулкунов. Когда война докатывается до коралловых рифов, Джейк понимает, что бежать больше некуда. Чтобы защитить своих детей и свой новый дом, ему придется принять бой в стихии, которую он только начал изучать. Это будет битва за выживание, где цена победы окажется невыносимо высокой, а океан станет свидетелем рождения новых героев.